施工中，首先要用料徑較小的砂土或粘土找平基面，然后再鋪設土工膜。土工膜不要繃得太緊，兩端埋入土體部分呈波紋狀，最后在所鋪的土工膜上用細砂或粘土鋪一層10cm左右過度層。砌上20-30cm塊石（或砼預制塊）作防沖保護層。
施工時，應盡力避免石塊直接砸在土工膜上，最好是邊鋪膜邊進行保護層的施工。復合土工膜與周邊結構物連接應采用膨脹螺栓和鋼板壓條錨固，連接部位要涂刷乳化瀝青（厚2mm）粘接，以防該處發生滲漏。
土工膜的接縫處理是一個關鍵工序，直接影響防滲效果。一般接縫方式有：①搭接：搭接寬度宜大于15cm；②熱焊：宜于稍厚的土工膜基材，焊縫搭接寬度不小于5CM。(不推薦膠接,長時間水浸泡易開膠,防滲效果差)根據多年實踐證明，防滲膜厚度不小于0.25mm，太薄可能產生氣孔，且易在施工中受損而降低防滲效果。土工膜施工中，特別要注意做到鋪設不宜過緊，不得打皺，拼接要牢固。
